毛发种植的手术并发症很少。最常见的是新生毛发不自然,呈簇状分布,但这种问题可通过改变发型解决,也可再行一次种植治疗。种植毛发周围的旅痕可能较明显,这个问题也可通过改变新发生长方向的方式解决。出血对种植头发的成活有一定的损害.但出血对身体键康不会有多大危害。
头皮部分切除术可在头顶部遗留较宽旅痕,尤其在切除皮肤较多、缝合张力较大时更是如此。头皮瓣转移术也会在供区留下较明显的瘢痕。
头皮扩张可能是所有这些手术中并发症类型最多的,且并发症都与扩张器有关,常见的有扩张器的渗漏、不张、露出等等,并发症的出现意味着手术失败。扩张失败后可以在3个月后重新手术。